Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim24Q0VG18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim24Q0VG18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms