Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkpd1Q0VF94 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkpd1Q0VF94 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms