Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col19a1Q0VF58 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col19a1Q0VF58 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms