Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hif3aQ0VBL6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms