Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt80Q0VBK2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms