Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrioQ0KL02 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrioQ0KL02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms