Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kndc1Q0KK55 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms