Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnnm1Q0GA42 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnnm1Q0GA42 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms