Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700061G19RikQ08EE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700061G19RikQ08EE8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms