Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssrp1Q08943 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssrp1Q08943 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms