Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn2Q08093 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms