Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ebf1Q07802 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ebf1Q07802 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ebf1Q07802 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms