Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrstQ06666 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrstQ06666 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrstQ06666 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrstQ06666 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrstQ06666 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms