Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc2Q05020 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms