Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox9Q04887 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms