Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Emx2Q04744 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms