Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcr5Q04683 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr5Q04683 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms