Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Aplp1Q03157 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aplp1Q03157 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Aplp1Q03157 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms