Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgfr4Q03142 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr4Q03142 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr4Q03142 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms