Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnb1Q02248 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms