Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcqQ02111 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms