Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ly9Q01965 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms