Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms