Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme2Q01768 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms