Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23aQ01405 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms