Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin2cQ01098 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2cQ01098 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms