Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbp1Q00915 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms