Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp4Q00724 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp4Q00724 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms