Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8a1Q00558 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
F8a1Q00558 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8a1Q00558 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms