Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GabpaQ00422 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GabpaQ00422 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms