Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PgrQ00175 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PgrQ00175 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms