Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Loxl1P97873 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Loxl1P97873 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Loxl1P97873 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Loxl1P97873 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Loxl1P97873 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms