Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr2cP97760 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2cP97760 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304.9 ms