Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas2P97460 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas2P97460 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas2P97460 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas2P97460 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas2P97460 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas2P97460 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas2P97460 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas2P97460 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms