Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps45P97390 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps45P97390 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps45P97390 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps45P97390 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps45P97390 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms