Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psme1P97371 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psme1P97371 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psme1P97371 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Psme1P97371 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psme1P97371 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psme1P97371 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psme1P97371 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psme1P97371 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Psme1P97371 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Psme1P97371 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Psme1P97371 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psme1P97371 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psme1P97371 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms