Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf1bP97358 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms