Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim43cP86449 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms