Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H3f3aP84244 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3f3aP84244 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms