Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf1P84078 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arf1P84078 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf1P84078 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms