Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms