Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx3P81067 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx3P81067 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx3P81067 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx3P81067 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx3P81067 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irx3P81067 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms