Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cct3P80318 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cct3P80318 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cct3P80318 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cct3P80318 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms