Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjb6P70689 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms