Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ufd1P70362 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms