Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aup1P70295 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aup1P70295 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms