Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp3P70281 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp3P70281 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sycp3P70281 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sycp3P70281 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sycp3P70281 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sycp3P70281 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp3P70281 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp3P70281 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp3P70281 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp3P70281 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp3P70281 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms