Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stra8P70278 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stra8P70278 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stra8P70278 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stra8P70278 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Stra8P70278 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Stra8P70278 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stra8P70278 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms