Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chl1P70232 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chl1P70232 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chl1P70232 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chl1P70232 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chl1P70232 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chl1P70232 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chl1P70232 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chl1P70232 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms