Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fv1P70213 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fv1P70213 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fv1P70213 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fv1P70213 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fv1P70213 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fv1P70213 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fv1P70213 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fv1P70213 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fv1P70213 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fv1P70213 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fv1P70213 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fv1P70213 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fv1P70213 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms